RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TEX22C9J3V5 150 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 K7EMT4 169 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 RHOHQ15669 191 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf159Q96HA4 380 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087X0K7 114 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 HLA-DRB4P13762 266 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 RITA1Q96K30 269 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM243Q9BU79 118 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CEP290O15078 2479 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GV72 72 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TAL2Q16559 108 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC13O75165 2243 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 KNCNA6PVL3 124 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 SIVA1O15304 175 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFS7O75251 213 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 KIR3DS1Q14943 382 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PRR31Q5SQ13 230 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 Q8N7P7 452 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 MED14OSP0DP75 135 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CCL24O00175 119 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf77Q96MU5 243 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CTSGP08311 255 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 P0C879 139 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB130BP0DP73 79 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB130AP0DP74 79 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 MPV17L2Q567V2 206 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZWC4 215 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CFHR4Q92496 578 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE12JA6NER3 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PAX4O43316 350 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 NPYP01303 97 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 COX8AP10176 69 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE1Q13065 139 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE4Q13068 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE5Q13069 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 ODF3BA8MYP8 253 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 HERVK_113P63121 156 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DLEU1O43261 78 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PATE2Q6UY27 113 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 JPT2Q9H910 190 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CST9LQ9H4G1 147 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 BUB3O43684 328 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV1-17P01599 117 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GPHB5Q86YW7 130 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C16orf74Q96GX8 76 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 MED12Q93074 2177 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 F8VRH5 84 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 IGHG2P01859 326 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2V1Q13404 147 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PRSS47A8MTI9 375 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 RMI2Q96E14 147 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE12BA1L429 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE7O76087 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE12FP0CL80 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE12GP0CL81 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE12IP0CL82 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 COX11Q9Y6N1 276 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 MSMPQ1L6U9 139 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 STPG4Q8N801 248 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 AJUBAQ96IF1 538 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 A6NDX4 124 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 F5H768 121 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CGB3P0DN86 165 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CGB7P0DN87 165 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 IGLC2P0DOY2 106 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 IGLC3P0DOY3 106 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms