RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630224.2

TCF4-269, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 501 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-269	ENST00000630224	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	SVBP	Q8N300	66 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	PARL	Q9H300	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224		C9JCJ5	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224		K7EQG2	157 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224		M0R036	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224		M0R3E3	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	SOCS3	O14543	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	NUDT3	O95989	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	RYR1	P21817	5038 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	SNAPIN	O95295	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ADIRF	Q15847	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	SORL1	Q92673	2214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224		B4DEV8	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	LTA	P01374	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF138	P52744	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	RHEB	Q15382	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224		Q86TA4	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	TSPO	P30536	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	DEFB131A	P59861	70 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	ERCC8	Q13216	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-269	ENST00000630224	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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