RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	MED21	Q13503	144 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	HMGN3	Q15651	99 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR4K15	Q8NH41	348 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	NEK7	Q8TDX7	302 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	FXYD5	Q96DB9	178 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	LINC01587	Q99440	93 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	PHB2	Q99623	299 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	METTL9	Q9H1A3	318 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A1B0GW64	132 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM189	A5PLL7	270 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694		M0QXV9	152 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	PDCD6	O75340	191 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	DHFR	P00374	187 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRH1	P02810	166 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	PTHLH	P12272	177 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	COX4I1	P13073	169 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	GID4	Q8IVV7	300 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	AMN1	Q8IY45	258 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF492	Q9P255	531 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694		K7ERS5	55 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	NDUFA4	O00483	81 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TNFAIP8	O95379	198 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPER1	Q99527	375 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMPX	Q9UHP9	88 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	GNG8	Q9UK08	70 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM212	A6NML5	194 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SULT1C2	O00338	296 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	NAPSA	O96009	420 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	APELA	P0DMC3	54 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR10A3	P58181	314 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAB31	Q13636	194 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	CDK10	Q15131	360 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	RTL8B	Q17RB0	113 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZFP82	Q8N141	532 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	GATD1	Q8NB37	220 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	MRAP2	Q96G30	205 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	S100A13	Q99584	98 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	2.68	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694		J3QRE1	110 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM107A	O95990	144 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	IFNA5	P01569	189 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	REG1A	P05451	166 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	CD2	P06729	351 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	HTR1A	P08908	422 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SERPINB10	P48595	397 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCL18	P55774	89 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	LPCAT4	Q643R3	524 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	C12orf73	Q69YU5	71 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF738	Q8NE65	137 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	TBX5	Q99593	518 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		2.67	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms