RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564131.1

RRN3-206, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 1,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-206ENST00000564131 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 ZNF479Q96JC4 524 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 RBAKDNA6NC62 111 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 SULT1A1P50225 295 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 CAV2P51636 162 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 ATP6V1FQ16864 119 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 Q8N814 137 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 PSCAO43653 123 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 CST7O76096 145 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 PYYP10082 97 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 BTCP35070 178 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 BCAP31P51572 246 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 HBG1P69891 147 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 HBG2P69892 147 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 ZNF846Q147U1 533 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 BAK1Q16611 211 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 TDRG1Q3Y452 100 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 Q6AWC8 147 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 Q6ZQT7 251 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 Q6ZSA8 131 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 CENPXA8MT69 81 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 SFTA3P0C7M3 94 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 INPP1P49441 399 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 HAMPP81172 84 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 BAXQ07812 192 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 TRIQKQ629K1 86 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 BLNKQ8WV28 456 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RRN3-206ENST00000564131 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 IL15RAQ13261 267 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 LAGE3Q14657 143 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 STX12Q86Y82 276 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 TMED6Q8WW62 240 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 OR51M1Q9H341 326 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 M0R2P5 195 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 CIDEAO60543 219 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 FGF7P21781 194 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 FXYD5Q96DB9 178 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 C2orf50Q96LR7 162 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 IGSF23A1L1A6 192 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 CCSO14618 274 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 CSN1S1P47710 185 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 MUC21Q5SSG8 566 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 Q8TAT8 98 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 PAXXQ9BUH6 204 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 TM2D2Q9BX73 214 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 C5orf51A6NDU8 294 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 FAM25EA8MYX2 175 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 PPT1P50897 306 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 LELP1Q5T871 98 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 SYT8Q8NBV8 401 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 DIRC3C9JPN6 131 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 ASAH1Q13510 395 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 OXTP01178 125 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3-206ENST00000564131 OR10J4P0C629 311 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms