RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 TCRAP04437 139 aa14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 SEC11BP0C7V7 166 aa14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 FHITP49789 147 aa14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.81□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 CBY3A6NI87 242 aa14.81□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 SNURFLB1AK76 121 aa14.81□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 RGS13O14921 159 aa14.81□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1W2PRE2 83 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 UBE2G2P60604 165 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 TVP23CQ96ET8 276 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 SGK494Q96LW2 274 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.8□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 UMAD1C9J7I0 102 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 Q6AWC8 147 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 FAM210BQ96KR6 192 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 EPDR1Q9UM22 224 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 F6UZH7 168 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 K7EQM0 130 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 C1QBP02746 253 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 AKAP14Q86UN6 197 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 TREM1Q9NP99 234 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD3-203ENST00000558455 FAM74A7A6NL05 159 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 ATP5G1P05496 136 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 ATP5G3P48201 142 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 MUC21Q5SSG8 566 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 STOML3Q8TAV4 291 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 ATG101Q9BSB4 218 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 GAGE12BA1L429 117 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 GAGE7O76087 117 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 IGLV2-11P01706 119 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 GAGE12FP0CL80 117 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 GAGE12GP0CL81 117 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 GAGE12IP0CL82 117 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 F5H768 121 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 IFNA7P01567 189 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TCL1AP56279 114 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 Q6ZTI0 123 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 PSG8Q9UQ74 426 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.74□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.74□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.74□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 NAGKQ9UJ70 344 aa14.74□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 PEX7O00628 323 aa14.73□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.73□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 PRNTQ86SH4 94 aa14.73□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 LINC00479Q96M42 142 aa14.73□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 C8orf49Q96NF6 230 aa14.73□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.72□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.72□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.72□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.72□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1B0GV50 99 aa14.72□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF415Q09FC8 603 aa14.72□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 SPINK4O60575 86 aa14.71□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.71□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.71□□□□□ -0.05
TMOD3-203ENST00000558455 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1B0GVG6 124 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 TDRG1Q3Y452 100 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 CST9LP1Q5W188 147 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 MDFICQ9P1T7 246 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 PAGE4O60829 102 aa14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 P0DMU3 169 aa14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 FAM231AP0DMU4 169 aa14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 FAM231CP0DMU5 169 aa14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 PPT1P50897 306 aa14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 ZFP69Q49AA0 526 aa14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TMOD3-203ENST00000558455 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms