RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548524.5

USP15-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-208ENST00000548524 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 Q8TAT8 98 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 CDIP1Q9H305 208 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 OTORQ9NRC9 128 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.71□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 RBAKDNA6NC62 111 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 DIRC3C9JPN6 131 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 NUDT3O95989 172 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 MBP02144 154 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 SERF2P84101 59 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 OR5I1Q13606 314 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 PRR9Q5T870 116 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ATG101Q9BSB4 218 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.69□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 RNF222A6NCQ9 220 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 M0R2N4 97 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 STAG3L2P0CL84 134 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 STAG3L3P0CL85 134 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 RNF212Q495C1 297 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 RAB24Q969Q5 203 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.68□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ARPC5O15511 151 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 CXorf1O96002 111 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 GCHFRP30047 84 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ZNF415Q09FC8 603 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 MUC21Q5SSG8 566 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 Q6ZTI0 123 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TMED6Q8WW62 240 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 A0A0J9YY99 117 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 K7EQM0 130 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TAAR5O14804 337 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 CCL18P55774 89 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TCL1AP56279 114 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 GNG5P63218 68 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 Q6ZQT7 251 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 NAGKQ9UJ70 344 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 DNAH2Q9P225 4427 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 F6UZH7 168 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 G3V3Q6 166 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 SMLR1H3BR10 107 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 SPINK4O60575 86 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 HOXA5P20719 270 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 Q6AWC8 147 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TREM1Q9NP99 234 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP15-208ENST00000548524 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.64□□□□□ -1.35
USP15-208ENST00000548524 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.64□□□□□ -1.35
USP15-208ENST00000548524 IGHV3-53P01767 116 aa6.64□□□□□ -1.35
USP15-208ENST00000548524 TCRAP04437 139 aa6.64□□□□□ -1.35
USP15-208ENST00000548524 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.64□□□□□ -1.35
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