RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532749.1

TMEM25-223, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 4

Gene TMEM25, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-223	ENST00000532749	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	MIF	P14174	115 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	RHEB	Q15382	184 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	TCRA	P04437	139 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	AKR1C3	P42330	323 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	LINC01551	Q86U37	167 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749		X6R8D5	127 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	HELT	A6NFD8	242 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	GALR1	P47211	349 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	BTN1A1	Q13410	526 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	LINC00479	Q96M42	142 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	ATG101	Q9BSB4	218 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-223	ENST00000532749	IGLV2-8	P01709	118 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	PSG9	Q00887	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	ADIRF	Q15847	76 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	ISOC2	Q96AB3	205 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	HERC1	Q15751	4861 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749		A0A087WWC5	75 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749		B4DEV8	164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749		K7EN84	100 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749		M0R3E3	92 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	ISLR	O14498	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TAS2R60	P59551	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	OCC1	Q8TAD7	63 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	CELA1	Q9UNI1	258 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	SOCS3	O14543	225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	GNG4	P50150	75 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	MEOX2	P50222	304 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	RNF212	Q495C1	297 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749		Q86TA4	180 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	LTA	P01374	205 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749		P0DMU3	169 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749		H3BMM0	161 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	GCG	P01275	180 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	UBE2G1	P62253	170 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-223	ENST00000532749	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-223	ENST00000532749	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-223	ENST00000532749	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-223	ENST00000532749	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-223	ENST00000532749	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-223	ENST00000532749	AMBP	P02760	352 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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