RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 C12orf74Q32Q52 190 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRN-218ENST00000497977 Q6ZTC4 211 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRN-218ENST00000497977 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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PTPRN-218ENST00000497977 C7orf71A4D174 169 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRN-218ENST00000497977 F6UZH7 168 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRN-218ENST00000497977 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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PTPRN-218ENST00000497977 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRN-218ENST00000497977 C8orf49Q96NF6 230 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRN-218ENST00000497977 PSG8Q9UQ74 426 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.39□□□□□ -1.23
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