RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.64□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 GCHFRP30047 84 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 SUN5Q8TC36 379 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 BLNKQ8WV28 456 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.63□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 H7BYZ3 331 aa9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TNP2Q05952 138 aa9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 ERCC8Q13216 396 aa9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.62□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.61□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 LEPP41159 167 aa9.61□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.61□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.61□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 ODF3Q96PU9 254 aa9.61□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.6□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.6□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.6□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 F5H768 121 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 ATP5G1P05496 136 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 ATP5G3P48201 142 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 ICAM4Q14773 271 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TEX261Q6UWH6 196 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 PRELID1Q9Y255 219 aa9.59□□□□□ -0.87
CHTF18-212ENST00000493715 CBY3A6NI87 242 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 RANP62826 216 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 BTN1A1Q13410 526 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 Q9H3A6 140 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 OTORQ9NRC9 128 aa9.58□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 NACAE9PAV3 2078 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 A0A1W2PRE2 83 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 C7orf71A4D174 169 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 KLLNB2CW77 178 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 IFNA7P01567 189 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 BLOC1S1P78537 153 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 C6orf223Q8N319 242 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 LINC00477Q96M19 166 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 VGLL1Q99990 258 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 ATG101Q9BSB4 218 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 HERC1Q15751 4861 aa9.57□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 A0A1B0GV50 99 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 TEX46H3BTG2 121 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 PPT1P50897 306 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 PRR9Q5T870 116 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.56□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 GAGE12BA1L429 117 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 PGPA6NDG6 321 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 FAM74A7A6NL05 159 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 SNURFLB1AK76 121 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 GGTLC3B5MD39 225 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 GAGE7O76087 117 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 NUDT3O95989 172 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 GAGE12FP0CL80 117 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 GAGE12GP0CL81 117 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 GAGE12IP0CL82 117 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 CRISP2P16562 243 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 CCL20P78556 96 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 Q6ZQT7 251 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.54□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 CSN1S1P47710 185 aa9.54□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 UBE2G2P60604 165 aa9.54□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.54□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 Q6ZTI0 123 aa9.54□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.54□□□□□ -0.88
CHTF18-212ENST00000493715 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms