RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 RNF182Q8N6D2 247 aa8.43□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 CACNA1HO95180 2353 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 IGLL5B9A064 214 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 K7ERJ3 54 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 C15orf32Q32M92 178 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 MRAP2Q96G30 205 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 F8W1H4 67 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TMEM160Q9NX00 188 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 U3KQE9 123 aa8.42□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 A0A1B0GWB2 263 aa8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 LY6HO94772 140 aa8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 CLEC3BP05452 202 aa8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 SLC25A16P16260 332 aa8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 CCDC140Q96MF4 163 aa8.41□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 SCGB1A1P11684 91 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 F8VRH5 84 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 H7C1H1 209 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 K7EMI3 77 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 C12orf74Q32Q52 190 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 SIRPDQ9H106 197 aa8.4□□□□□ -1.06
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ATP6V0BQ99437 205 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ATP6V0E1O15342 81 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 TOMM6Q96B49 74 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 AJUBAQ96IF1 538 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ZNF479Q96JC4 524 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 METTL26Q96S19 204 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 LAMA5O15230 3695 aa8.39□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ECSCRQ19T08 205 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 C20orf78Q9BR46 151 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 EFNA4P52798 201 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 RRN3P1Q2M238 152 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 APC2O95996 2303 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 UBE2E1P51965 193 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 M0R381 172 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 MED14OSP0DP75 135 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 HIST1H4GQ99525 98 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 PRO0461Q9UI25 63 aa8.37□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 POLEQ07864 2286 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 MGAQ8IWI9 3026 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 J3QR89 54 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 PRR9Q5T870 116 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 SPATA25Q9BR10 227 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 CEP250Q9BV73 2442 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 OR11H12B2RN74 326 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 H3BVH4 76 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 K7ENP7 123 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 WFDC2Q14508 124 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 OR11H1Q8NG94 326 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 OR11H2Q8NH07 326 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 GLMPQ8WWB7 406 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 RASL10AQ92737 203 aa8.36□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 RNF223E7ERA6 249 aa8.35□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 Q6ZQT7 251 aa8.35□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 SIGMAR1Q99720 223 aa8.35□□□□□ -1.07
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