RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRHP06850 196 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R1AQ13522 171 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q3ZCU0 254 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 CST9Q5W186 159 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 C4orf22Q6V702 233 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCL2L10Q9HD36 194 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBAP1Q9NZ09 502 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.98□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLXNB2O15031 1838 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 OBSL1O75147 1896 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP54Q70EL1 1684 aa-0.99□□□□□ -2.57
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CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM25EA8MYX2 175 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5G3P0C626 314 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 UGT2B7P16662 529 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAA20P61599 178 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 RSU1Q15404 277 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFXN4Q6P4A7 337 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 COMMD7Q86VX2 200 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDZD9Q8IXQ8 264 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5AS1Q8N127 324 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR52R1Q8NGF1 315 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 C3orf18Q9UK00 162 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCTPQ9UKL6 214 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRAPQ86VF7 1730 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 SBF2Q86WG5 1849 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMLR1H3BR10 107 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR31O00270 319 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 RD3LP0DJH9 198 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXCL8P10145 99 aa-1□□□□□ -2.57
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CACNA2D1-211ENST00000486539 Q86TA4 180 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf111Q8N326 155 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 WFDC9Q8NEX5 89 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCAPERQ9BY12 1400 aa-1□□□□□ -2.57
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CACNA2D1-211ENST00000486539 GLI2P10070 1586 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 MADDQ8WXG6 1647 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADCY10Q96PN6 1610 aa-1□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087X0T9 212 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 GADD45GO95257 159 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DRB1P01911 266 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD79AP11912 226 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTMSP20962 102 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCTAP57738 103 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 DYNLT1P63172 113 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMAIP1Q13794 54 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLVS2Q5SYC1 327 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf195Q5TG92 126 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2T35Q8NGX2 323 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q8TAT8 98 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLK6Q92876 244 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 C19orf60Q96EN9 201 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BLQ99880 126 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 OPTCQ9UBM4 332 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF21BO75037 1637 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADGBQ8N7X0 1667 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 BTAF1O14981 1849 aa-1.01□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa-1.02□□□□□ -2.57
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-1.02□□□□□ -2.57
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