RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00886-201ENST00000472943 LY6HO94772 140 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00886-201ENST00000472943 LAGE3Q14657 143 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00886-201ENST00000472943 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00886-201ENST00000472943 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00886-201ENST00000472943 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.96□□□□□ -1.13
LINC00886-201ENST00000472943 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
LINC00886-201ENST00000472943 BUB3O43684 328 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 WFDC2Q14508 124 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 A0A087WX48 190 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SCGB2A1O75556 95 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TAL2Q16559 108 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.96□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 F8W1H4 67 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 PRTN3P24158 256 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 C12orf74Q32Q52 190 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF479Q96JC4 524 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 M0R1W7 72 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 AZU1P20160 251 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 LINC01560Q8TB33 94 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 GOSR1O95249 250 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 EFNA4P52798 201 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 Q6ZQT7 251 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 H3BMG7 143 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ABCA4P78363 2273 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 PLNP26678 52 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 EBI3Q14213 229 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 C15orf32Q32M92 178 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 CIDEAO60543 219 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 HIST1H4GQ99525 98 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SIGMAR1Q99720 223 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 CLEC3BP05452 202 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SCGB1A1P11684 91 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM11P17152 192 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 RAB9AP51151 201 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 AMTNQ6UX39 209 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 Q8N9W7 124 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 PRO0461Q9UI25 63 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TTC28Q96AY4 2481 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1B0GWB2 263 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 F8VRH5 84 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 RRN3P1Q2M238 152 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 LINC01619G3V211 115 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 H7C1H1 209 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ETDBQ3ZM63 59 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC140Q96MF4 163 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SPATA25Q9BR10 227 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 MTURNQ8N3F0 131 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 OOSP1A8MZH6 123 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 ECSCRQ19T08 205 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 KLK9Q2XQG4 91 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 H3BVH4 76 aa7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 GAGE13Q4V321 117 aa7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 PRR9Q5T870 116 aa7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 MRAP2Q96G30 205 aa7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 TIMD4Q96H15 378 aa7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
LINC00886-201ENST00000472943 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms