RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 RPH3ALQ9UNE2 315 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR9Q5T870 116 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM74A7A6NL05 159 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB5CP51148 216 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 DAD1P61803 113 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6AWC8 147 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC51BQ86UW2 128 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG101Q9BSB4 218 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLL5B9A064 214 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM210BQ96KR6 192 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TENM2Q9NT68 2774 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SNURFLB1AK76 121 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS13O14921 159 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV2-11P01706 119 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2G2P60604 165 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TVP23CQ96ET8 276 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TREM1Q9NP99 234 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 APLNQ9ULZ1 77 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 PSG8Q9UQ74 426 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GVG6 124 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 CBY3A6NI87 242 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNA7P01567 189 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB130BP0DP73 79 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB130AP0DP74 79 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFP69Q49AA0 526 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 SULT1A2P50226 295 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZQT7 251 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 F6UZH7 168 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 PEX7O00628 323 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 PPT1P50897 306 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 TDRG1Q3Y452 100 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 SGK494Q96LW2 274 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 RYR3Q15413 4870 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5G1P05496 136 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5G3P48201 142 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 TCL1AP56279 114 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 CST9LP1Q5W188 147 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 PRNTQ86SH4 94 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 PAGE4O60829 102 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00479Q96M42 142 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 C18orf15Q96N68 181 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 RYR2Q92736 4967 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX46H3BTG2 121 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 LY6G6CO95867 125 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 HTN3P15516 51 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 SMUG1Q53HV7 270 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 MUC21Q5SSG8 566 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-204ENST00000442563 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINK4O60575 86 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF415Q09FC8 603 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNS1Q96KK3 526 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf49Q96NF6 230 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 LYSTQ99698 3801 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 GAGE12BA1L429 117 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 GAGE7O76087 117 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 GCGP01275 180 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 GAGE12FP0CL80 117 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 GAGE12GP0CL81 117 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 GAGE12IP0CL82 117 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms