RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX7B2Q8TF08 81 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 USMG5Q96IX5 58 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXL12Q9NXK8 326 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA0556O60303 1618 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCORQ6W2J9 1755 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf196B1AJZ1 125 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOL3O60936 208 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYPLA2O95372 231 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINE1P05121 402 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM53Q6P2H8 277 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM228AQ86W67 206 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD302Q8IX05 232 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOC8Q8IYI6 725 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8J3Q8NGG0 315 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR6N2Q8NGY6 317 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXTL2Q9UBQ6 330 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGXB3Q12766 1538 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 E2F6O75461 281 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYZL1O95825 349 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 IDO1P14902 403 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 RANP62826 216 aaKnown RBP-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF5Q12774 1597 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCSMST1Q4G0I0 132 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM81AQ8TBF8 368 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKIBQ9C010 78 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMBIM4Q9HC24 238 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLOC1S6Q9UL45 172 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 MGAQ8IWI9 3026 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM94Q12767 1356 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAG6O75602 509 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-EP13747 358 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJB13P59910 316 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYCE1Q8N0S2 351 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8J2Q8NGG1 315 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM172AQ8WUF8 416 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 BPIFA3Q9BQP9 254 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 LXNQ9BS40 222 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIPINQ9BVW5 301 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCNT4Q9P109 453 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 RABL2BQ9UNT1 228 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADCY9O60503 1353 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 PITX3O75364 302 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 WBP4O75554 376 aaKnown RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP3S2P59780 193 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB5BP61020 215 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 COQ5Q5HYK3 327 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 C3orf33Q6P1S2 294 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 STOML3Q8TAV4 291 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 RMND1Q9NWS8 449 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 DKKL1Q9UK85 242 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFT172Q9UG01 1749 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 F8VRH5 84 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 ORM1P02763 201 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC35E2BP0CK96 405 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARF6P62330 175 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2BP63146 152 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST3H3Q16695 136 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC148Q8NFR7 591 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 PBDC1Q9BVG4 233 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPCDR1Q9BY65 106 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 C20orf27Q9GZN8 174 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 VPS29Q9UBQ0 182 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGD6Q6ZV73 1430 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEO1Q92859 1461 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GTQ1 180 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAPL1A0PJW8 107 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3QRK9 145 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA1P01009 418 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIMS3P0CW19 117 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIMS4P0CW20 117 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGF7P21781 194 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCR4P61073 352 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
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