RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409958.6

VSX1-204, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VSX1, Length 1,305 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-204ENST00000409958 SNURFLB1AK76 121 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 GGTLC3B5MD39 225 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 PFDN1O60925 122 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 CBY3A6NI87 242 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 RGS13O14921 159 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TCRAP04437 139 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 HTN3P15516 51 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 UMAD1C9J7I0 102 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 K7EQM0 130 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 Q6AWC8 147 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 Q6ZQT7 251 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 EPDR1Q9UM22 224 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 STOML3Q8TAV4 291 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 C1QBP02746 253 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 ATP5G1P05496 136 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 ATP5G3P48201 142 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TVP23CQ96ET8 276 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TREM1Q9NP99 234 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 FHITP49789 147 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 UBE2G2P60604 165 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 ATG101Q9BSB4 218 aa14.66□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 FAM74A7A6NL05 159 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TCL1AP56279 114 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 AKAP14Q86UN6 197 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 SGK494Q96LW2 274 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 PSG8Q9UQ74 426 aa14.65□□□□□ -0.06
VSX1-204ENST00000409958 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.64□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.64□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.64□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.64□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.64□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 KMT2AQ03164 3969 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 GAGE12BA1L429 117 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 F5H768 121 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 GAGE7O76087 117 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 IFNA7P01567 189 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 IGLV2-11P01706 119 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 GAGE12FP0CL80 117 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 GAGE12GP0CL81 117 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 GAGE12IP0CL82 117 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 MUC21Q5SSG8 566 aa14.63□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 F6UZH7 168 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 Q6ZTI0 123 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.62□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 SPINK4O60575 86 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 P0DMU3 169 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 FAM231AP0DMU4 169 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 FAM231CP0DMU5 169 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 ZNF415Q09FC8 603 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TDRG1Q3Y452 100 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 C18orf15Q96N68 181 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 PEX7O00628 323 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 PRNTQ86SH4 94 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 PPT1P50897 306 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 LINC00479Q96M42 142 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 C8orf49Q96NF6 230 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 NAGKQ9UJ70 344 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX1-204ENST00000409958 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX1-204ENST00000409958 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX1-204ENST00000409958 RAB5CP51148 216 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX1-204ENST00000409958 ZFP69Q49AA0 526 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX1-204ENST00000409958 SMUG1Q53HV7 270 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms