RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 F6UZH7 168 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TEX46H3BTG2 121 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 PMS2P11Q13670 270 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TDRG1Q3Y452 100 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 Q6ZTC4 211 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SSX7Q7RTT5 188 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 CELA1Q9UNI1 258 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 CBY3A6NI87 242 aa8.7□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM74A7A6NL05 159 aa8.7□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.7□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.7□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.7□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SNURFLB1AK76 121 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 AZU1P20160 251 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SULT1A2P50226 295 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 EMP1P54849 157 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 DAD1P61803 113 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 CD300CQ08708 224 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 KIR3DS1Q14943 382 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 ZFP69Q49AA0 526 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TREM1Q9NP99 234 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.69□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 RGS13O14921 159 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 BTN1A1Q13410 526 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 KCNS1Q96KK3 526 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 PEX7O00628 323 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 IFNA7P01567 189 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 IGLV2-11P01706 119 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP5G1P05496 136 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP5G3P48201 142 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TCL1AP56279 114 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 Q8TAT8 98 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 FMC1Q96HJ9 113 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 MANBALQ9NQG1 85 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 PSG8Q9UQ74 426 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 RYR2Q92736 4967 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 KMT2AQ03164 3969 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 HTN1P15515 57 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SMUG1Q53HV7 270 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 PRR9Q5T870 116 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SPXQ9BT56 116 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 APLNQ9ULZ1 77 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 IGLL5B9A064 214 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 H3BNG1 76 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 J3KRW8 73 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 SPINK4O60575 86 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 GNG5P63218 68 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF415Q09FC8 603 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 TVP23CQ96ET8 276 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 UBE2G2P60604 165 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 MUC4Q99102 2169 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 PRM2P04554 102 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 P0DMU3 169 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM231AP0DMU4 169 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM231CP0DMU5 169 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 DEFB130BP0DP73 79 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 DEFB130AP0DP74 79 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 SLAQ13239 276 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 CST9LP1Q5W188 147 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 RASL10AQ92737 203 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms