RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAGE12BA1L429 117 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAAR5O14804 337 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS13O14921 159 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAGE7O76087 117 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAGE12FP0CL80 117 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAGE12GP0CL81 117 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAGE12IP0CL82 117 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZTI0 123 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 NACAE9PAV3 2078 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf1O96002 111 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCL1AP56279 114 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6AWC8 147 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGTLC3B5MD39 225 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF345Q14585 488 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXA5P20719 270 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC21Q5SSG8 566 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TVP23CQ96ET8 276 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH2Q9P225 4427 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINK4O60575 86 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRAP04437 139 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMSDA8MTL9 139 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 F6UZH7 168 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF212Q495C1 297 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGK494Q96LW2 274 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 C18orf15Q96N68 181 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC4Q99102 2169 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT3O95989 172 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF415Q09FC8 603 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5I1Q13606 314 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TREM1Q9NP99 234 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRE2 83 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV2-11P01706 119 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDFICQ9P1T7 246 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAGKQ9UJ70 344 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPDR1Q9UM22 224 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAT2Q9NYQ8 4349 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7EQM0 130 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2L11O43521 198 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDRG1Q3Y452 100 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG101Q9BSB4 218 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSG8Q9UQ74 426 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0D9SG52 128 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0J9YY99 117 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2G2P60604 165 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf49Q96NF6 230 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R2N4 97 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 FHITP49789 147 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM74A7A6NL05 159 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BNG1 76 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC11BP0C7V7 166 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZR54 194 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-53P01767 116 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TYMSP04818 313 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRNTQ86SH4 94 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms