RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 HS3ST6Q96QI5 342 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 SORL1Q92673 2214 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 CCL25O15444 150 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGHV3-48P01763 117 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C14orf144Q96I85 54 aa5.02□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 PCSK5Q92824 1860 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 TRACP01848 142 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 SPINK8P0C7L1 97 aa5.01□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 TFPI2P48307 235 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 F8WEM9 126 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 I3L2K1 104 aa5.01□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 PCNTO95613 3336 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 WIPF3A6NGB9 483 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 RASL10AQ92737 203 aa5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 MUC6Q6W4X9 2439 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 BUB3O43684 328 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ARMS2P0C7Q2 107 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 CD5LO43866 347 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 OCIAD2Q56VL3 154 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 RNF144BQ7Z419 303 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C10orf105Q8TEF2 133 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 M0R2P5 195 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGLV2-14P01704 120 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C5orf56Q8N8D9 126 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C18orf32Q8TCD1 76 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 CST9LQ9H4G1 147 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 SS18Q15532 418 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 GLMPQ8WWB7 406 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 F8VRH5 84 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 WISP1O95388 367 aa5□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 CTSZQ9UBR2 303 aa5□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 LGALS9O00182 355 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 SAP30O75446 220 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ZNF876PQ49A33 203 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 LYNX1P0DP58 116 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 VGLL1Q99990 258 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ZNF726P1Q15940 193 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ZNF479Q96JC4 524 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 HERVK_113P63121 156 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 RMI2Q96E14 147 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 AZU1P20160 251 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ERCC8Q13216 396 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.99□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 Q8N9W7 124 aa4.99□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 GAGE1Q13065 139 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 C18orf15Q96N68 181 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 A0A087WX48 190 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IFITM1P13164 125 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 Q8NA96 180 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 H7C423 109 aa4.98□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGHV3-11P01762 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGHV3-23P01764 117 aa4.98□□□□□ -1.61
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