RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM23	O14925	209 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	CXorf1	O96002	111 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXI1	Q12951	378 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZPA2	131 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	DRAM1	Q8N682	238 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX45	Q8NA69	505 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ARPC1A	Q92747	370 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	PLXNB1	O43157	2135 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	APOM	O95445	188 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	G6PC	P35575	357 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF329	Q86UD4	541 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		5.71	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	NXPH3	O95157	252 aa		5.71	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R45	P59539	299 aa		5.71	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	BLCAP	P62952	87 aa		5.71	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.71	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.49
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PRE2	83 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		E9PLD3	99 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	RHOD	O00212	210 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TCTA	P57738	103 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	DPM3	Q9P2X0	92 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2E1	P51965	193 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	OR9G1	Q8NH87	305 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRO0461	Q9UI25	63 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FNDC10	F2Z333	226 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZS46	218 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM262	E9PQX1	116 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BMG7	143 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		J3QLI3	93 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB2A1	O75556	95 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IAPP	P10997	89 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	HCP5	Q6MZN7	132 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R1W7	72 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINK4	O60575	86 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	EVI2A	P22794	236 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	CNTFR	P26992	372 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	INSL3	P51460	131 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6Q795	121 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GWB2	263 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	C15orf65	H3BRN8	121 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	AREG	P15514	252 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	OPRK1	P41145	380 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	VWC2	Q2TAL6	325 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMG4	Q5JS54	123 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRELID3A	Q96N28	172 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FCGR3B	O75015	233 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IFITM1	P13164	125 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR20E	P86478	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR20C	P86479	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR20D	P86480	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR20B	P86481	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR20A	P86496	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXE3	Q13461	319 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	KIR2DS1	Q14954	304 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PSG5	Q15238	335 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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