RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.95□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 SDK2Q58EX2 2172 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB136Q30KP8 78 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM186AA6NE01 2351 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM231BA6NCW3 169 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CRYBA4P53673 196 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 hADV29S1A0JD25 119 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-59P01825 116 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01551Q86U37 167 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 SOCS3O14543 225 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CACNA1BQ00975 2339 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 PDE6HQ13956 83 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.94□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 MPZP25189 248 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 C9JAW5 83 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CRLF1O75462 422 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 XCL1P47992 114 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 WISP1O95388 367 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ABCA4P78363 2273 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 SVIPQ8NHG7 77 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 PIFOQ8TCI5 191 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 PI4KAP42356 2102 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TCF15Q12870 199 aa6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 HAMPP81172 84 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM141Q96I45 108 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CACNA1EQ15878 2313 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ELANEP08246 267 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 DSCR8Q96T75 97 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 CCL18P55774 89 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8TCH9 128 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ETDBQ3ZM63 59 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0G2JRQ6 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 F8W735 103 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.92□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFS7O75251 213 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 GP9P14770 177 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NBL1P41271 181 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV3-30P01768 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV3-33P01772 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 V9GYY9 64 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.91□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 BUB3O43684 328 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF134P52741 427 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 STPG4Q8N801 248 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF503Q96F45 646 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TIMM17AQ99595 171 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 RHOHQ15669 191 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 TIRAPP58753 221 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 U3KQE9 123 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 LCTP09848 1927 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 SBF1O95248 1867 aa6.9□□□□□ -1.3
CYFIP1-208ENST00000617928 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms