RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597775.1

LINC02028-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2028, human

TSL 5

Gene LINC02028, Length 737 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC02028-208	ENST00000597775	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775		H3BRN7	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	TGOLN2	O43493	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	HYPM	O75409	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	BCL2	P10415	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	ORM2	P19652	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	NPPC	P23582	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	GCHFR	P30047	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	PFDN5	Q99471	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	RNF2	Q99496	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	NDUFA4	O00483	81 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	PAGE4	O60829	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	CXorf1	O96002	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	IL4	P05112	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	PYY	P10082	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	ATP5G3	P48201	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	PSMB3	P49720	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	LYZ	P61626	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	PEA15	Q15121	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775		Q8WTZ3	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775		X6R8D5	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	AGRN	O00468	2067 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC02028-208	ENST00000597775	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775		H3BQ15	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775		K7EMT4	169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	FABP1	P07148	127 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	OR10J4	P0C629	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	TFPI2	P48307	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	PPT1	P50897	306 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	UBE2G2	P60604	165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	CHEK1	O14757	476 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	OR7C2	O60412	319 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	NDUFB4	O95168	129 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	IFNA1	P01562	189 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	CRYBB3	P26998	211 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	TAS2R45	P59539	299 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	RNF212	Q495C1	297 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC02028-208	ENST00000597775	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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