RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591064.1

ZNF180-208, Transcript of zinc finger protein 180, human

TSL 3

Gene ZNF180, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF180-208	ENST00000591064	NMB	P08949	121 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	ERCC8	Q13216	396 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064		Q6ZTC4	211 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	VGLL1	Q99990	258 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	PGP	A6NDG6	321 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	KLLN	B2CW77	178 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	CXorf1	O96002	111 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	CRISP2	P16562	243 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	GCHFR	P30047	84 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF180-208	ENST00000591064	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	DIRC3	C9JPN6	131 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064		J3KRW8	73 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	PRM2	P04554	102 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF138	P52744	262 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	TCTA	P57738	103 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	C16orf74	Q96GX8	76 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	C7orf71	A4D174	169 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	BCL2L11	O43521	198 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	GPX1	P07203	203 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	HTN1	P15515	57 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	AZU1	P20160	251 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	LYST	Q99698	3801 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	CD300C	Q08708	224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	IGLL5	B9A064	214 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	PFDN1	O60925	122 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	DAD1	P61803	113 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064		Q8TAT8	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064		A0A1W2PRE2	83 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF180-208	ENST00000591064	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	PRR9	Q5T870	116 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064		K7EQM0	130 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	C1QB	P02746	253 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	TCRA	P04437	139 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	GNG5	P63218	68 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	STOML3	Q8TAV4	291 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	APLN	Q9ULZ1	77 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ZNF180-208	ENST00000591064	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.87	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms