RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD2Q9UBB5 411 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 H7BYZ3 331 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 IFNA5P01569 189 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 CT45A10P0DMU9 189 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ICAM4Q14773 271 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 HSPB11Q9Y547 144 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ALG5Q9Y673 324 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 SNURFLB1AK76 121 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF253O75346 499 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFB4O95168 129 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 NUDT3O95989 172 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 OXA1LQ15070 435 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ATG101Q9BSB4 218 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 PAXXQ9BUH6 204 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 OR51M1Q9H341 326 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP5G1P05496 136 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP5G3P48201 142 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 BTN1A1Q13410 526 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 PDE6HQ13956 83 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM210BQ96KR6 192 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 FUT9Q9Y231 359 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 PRELID1Q9Y255 219 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 GAGE12BA1L429 117 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 C7orf71A4D174 169 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 GAGE7O76087 117 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 GAGE12FP0CL80 117 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 GAGE12GP0CL81 117 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 GAGE12IP0CL82 117 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 KHDC3LQ587J8 217 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF141Q8WVD5 230 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 ODF3Q96PU9 254 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 MED28Q9H204 178 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-209ENST00000587957 CBY3A6NI87 242 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 GPX1P07203 203 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 CSN1S1P47710 185 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 TAS2R45P59539 299 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 RANP62826 216 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 CD300CQ08708 224 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 OR5I1Q13606 314 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8TAT8 98 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 FXYD5Q96DB9 178 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 HYLS1Q96M11 299 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 VGLL1Q99990 258 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 RGS13O14921 159 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 PTTG1O95997 202 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00477Q96M19 166 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 Q9H3A6 140 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 WFDC1Q9HC57 220 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A0J9YY99 117 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PPV4 95 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB2AP61019 212 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 NACAE9PAV3 2078 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 KLLNB2CW77 178 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF138P52744 262 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-209ENST00000587957 MUC21Q5SSG8 566 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms