RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569053.5

TMX3-210, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMX3, Length 940 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-210ENST00000569053 GOSR2O14653 212 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 SPINK4O60575 86 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 NDUFB6O95139 128 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 SCGB1D2O95969 90 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 IGHV3-53P01767 116 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 OR4E1P0C645 316 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 S100A7P31151 101 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 MIC13Q5XKP0 118 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 ODF3Q96PU9 254 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 FUT9Q9Y231 359 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 C7orf71A4D174 169 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 KLLNB2CW77 178 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 CCSO14618 274 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 COX7A2P2O60397 106 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 LEPP41159 167 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 AP3S2P59780 193 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 FHL2Q14192 279 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 C4orf46Q504U0 113 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 ZNF546Q86UE3 836 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 SRRQ9GZT4 340 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 PRAF2O60831 178 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 TSC22D2O75157 780 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 TAS2R30P59541 319 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.34□□□□□ -1.23
TMX3-210ENST00000569053 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 PAX4O43316 350 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 PYYP10082 97 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 CRYBA4P53673 196 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 TCL1AP56279 114 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 C8orf49Q96NF6 230 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 VGLL1Q99990 258 aa7.33□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 CST7O76096 145 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 CAMLGP49069 296 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 ERVFC1-1P60608 527 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 GGACTQ9BVM4 153 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.32□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 IGSF23A1L1A6 192 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 SFTA3P0C7M3 94 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 CRISP2P16562 243 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 ICAM4Q14773 271 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 VWC2Q2TAL6 325 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 MITD1Q8WV92 249 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.31□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 K7EQD1 137 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 ZNF253O75346 499 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 GUK1Q16774 197 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 S100A7AQ86SG5 101 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 FRZBQ92765 325 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 ZNF479Q96JC4 524 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 PRO0255Q9UI72 69 aa7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
TMX3-210ENST00000569053 E5RGE8 158 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms