RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567947.1

CBFB-208, Transcript of core-binding factor subunit beta, human

TSL 3

Gene CBFB, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBFB-208	ENST00000567947	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CAD	P27708	2225 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ROS1	P08922	2347 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		A0A087WX48	190 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		A0A1B0GWB2	263 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		A0A1B0GX51	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CDA	P32320	146 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	MPV17	P39210	176 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	MAGEA5	P43359	124 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FGF12	P61328	243 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SRY	Q05066	204 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CATR1	Q13166	79 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF146	Q15072	292 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CENPW	Q5EE01	88 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		Q6AWC8	147 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ATOH7	Q8N100	152 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	RPRML	Q8N4K4	120 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		Q8N7P7	452 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	OR51H1	Q8NH63	302 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	NRGN	Q92686	78 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	LITAF	Q99732	161 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	DSCAM	O60469	2012 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		A8MWL6	223 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	C15orf65	H3BRN8	121 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FCN3	O75636	299 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	APOM	O95445	188 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	COX6B1	P14854	86 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	MFAP2	P55001	183 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	GNG3	P63215	75 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	PLGLB1	Q02325	96 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FGFRL1	Q8N441	504 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	NUP35	Q8NFH5	326 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	RPE	Q96AT9	228 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FOXC2	Q99958	501 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	CITED1	Q99966	193 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	HINT2	Q9BX68	163 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF492	Q9P255	531 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	PRO0461	Q9UI25	63 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ACAN	P16112	2415 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		H3BP45	60 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947		M0R135	149 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ZNHIT1	O43257	154 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SPINT2	O43291	252 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1-39	P01597	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IGLV2-8	P01709	118 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1D-39	P04432	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ATP5G1	P05496	136 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.78	□□□□□ -1.8

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