RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF503Q96F45 646 aa14.13□□□□□ -0.15
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CMTM3-211ENST00000565922 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
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CMTM3-211ENST00000565922 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
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CMTM3-211ENST00000565922 FAM231CP0DMU5 169 aa14.1□□□□□ -0.15
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CMTM3-211ENST00000565922 DEFB130AP0DP74 79 aa14.09□□□□□ -0.15
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CMTM3-211ENST00000565922 STAG3L2P0CL84 134 aa14.06□□□□□ -0.16
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CMTM3-211ENST00000565922 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 CD300CQ08708 224 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
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CMTM3-211ENST00000565922 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.04□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 Q8TAT8 98 aa14.04□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.04□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 F5H768 121 aa14.03□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 G3V3Q6 166 aa14.03□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 RGS13O14921 159 aa14.03□□□□□ -0.16
CMTM3-211ENST00000565922 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
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CMTM3-211ENST00000565922 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.02□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.02□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.02□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.02□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.02□□□□□ -0.17
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CMTM3-211ENST00000565922 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.01□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 KMT2AQ03164 3969 aa14□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF345Q14585 488 aa14□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 PRR9Q5T870 116 aa14□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 C5orf17Q8NAS9 161 aa14□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 SUN5Q8TC36 379 aa14□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.99□□□□□ -0.17
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