RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.3□□□□□ -1.4
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CLSTN3-212ENST00000541770 OTORQ9NRC9 128 aa6.3□□□□□ -1.4
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CLSTN3-212ENST00000541770 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.28□□□□□ -1.4
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CLSTN3-212ENST00000541770 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.28□□□□□ -1.4
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CLSTN3-212ENST00000541770 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF492Q9P255 531 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 EPDR1Q9UM22 224 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-212ENST00000541770 K7EQM0 130 aa6.24□□□□□ -1.41
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