RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 DLX6P56179 175 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 RBAKDNA6NC62 111 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 M0QXV9 152 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 ORM1P02763 201 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZUT4 128 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TEN1Q86WV5 123 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 C17orf77Q96MU5 243 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 CDIP1Q9H305 208 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SPEGQ15772 3267 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 KNTC1P50748 2209 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 FRYLO94915 3013 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 K7EIM0 57 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 M0R3E3 92 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 MFAP4P55083 255 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 DMDP11532 3685 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 CACNA1GO43497 2377 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 C17orf100A8MU93 164 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 TMEM178BH3BS89 294 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 CNIH1O95406 144 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 ATP5G2Q06055 141 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 TCF15Q12870 199 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 GAGE5Q13069 117 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 GAGE6Q13070 117 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 DEFB124Q8NES8 71 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 C20orf78Q9BR46 151 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 PRRG2O14669 202 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 ASIPP42127 132 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 AMTNQ6UX39 209 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 DTX2Q86UW9 622 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 RAXQ9Y2V3 346 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 A8MWV9 139 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 ZNF688P0C7X2 276 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 TEX29Q8N6K0 151 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 PRSS33Q8NF86 280 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R17O96001 155 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 INSL3P51460 131 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 UBE2D1P51668 147 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 UBE2D3P61077 147 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 HERVK_113P61574 105 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 UBE2D2P62837 147 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 CCL8P80075 99 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 FBXL15Q9H469 300 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 C16orf97H3BN30 126 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 NDUFA3O95167 84 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 IGLV1-47P01700 117 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 PSMB2P49721 201 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 APELAP0DMC3 54 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 NRACQ8N912 160 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 FCN3O75636 299 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 MT-ATP8P03928 68 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 CNTFRP26992 372 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 NBL1P41271 181 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 TOMM6Q96B49 74 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-215ENST00000537304 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms