RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535120.1

MRE11-205, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, human

TSL 2

Gene MRE11, Length 234 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRE11-205	ENST00000535120	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120		K7EQD1	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TNFSF8	P32971	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	PPT1	P50897	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SLA	Q13239	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120		Q6ZRG5	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	KLLN	B2CW77	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120		K7EPK0	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120		L7N2F9	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	LECT2	O14960	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TSC22D2	O75157	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	PYY	P10082	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	CAMLG	P49069	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	VAMP2	P63027	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	RAB31	Q13636	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	GUK1	Q16774	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	PRR9	Q5T870	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120		Q8N814	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120		Q8TAT8	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	VGLL1	Q99990	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	CST7	O76096	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	INPP1	P49441	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	CAV2	P51636	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	BAX	Q07812	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120		C9JCJ5	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	CCS	O14618	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	ORM1	P02763	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	PFDN5	Q99471	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRE11-205	ENST00000535120	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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