RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, human

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN3-208	ENST00000531226	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	VGLL1	Q99990	258 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	LINC01587	Q99440	93 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	PGP	A6NDG6	321 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	DIRC3	C9JPN6	131 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226		J3KRW8	73 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	EMP1	P54849	157 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMUB2	Q71RG4	321 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TENM2	Q9NT68	2774 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	KLLN	B2CW77	178 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226		H7BYZ3	331 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	PFDN1	O60925	122 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	PRM2	P04554	102 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	CRISP2	P16562	243 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TAS2R60	P59551	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	C1QB	P02746	253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	NMB	P08949	121 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF138	P52744	262 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	C7orf71	A4D174	169 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	C11orf94	C9JXX5	98 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	C12orf74	Q32Q52	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226		Q6ZTC4	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226		Q8TAT8	98 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	HTN1	P15515	57 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	AZU1	P20160	251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	BTN1A1	Q13410	526 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	GPX1	P07203	203 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	GNG5	P63218	68 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	CD300C	Q08708	224 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	LCE6A	A0A183	80 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	PRR9	Q5T870	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226		A0A1W2PRE2	83 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	FHIT	P49789	147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	TCRA	P04437	139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226		A0A1B0GVG6	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226		K7EQM0	130 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	UBE2G2	P60604	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	DAD1	P61803	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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