RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 CCL25O15444 150 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TCF21O43680 179 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PYYP10082 97 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGLL1P15814 213 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 NTF3P20783 257 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CDKN1BP46527 198 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GNG10P50151 68 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DLX6P56179 175 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SLC35B1P78383 322 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CXCL6P80162 114 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 WT1-ASQ06250 92 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM201AQ5SY85 155 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LCN12Q6JVE5 192 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PET117Q6UWS5 81 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LEAP2Q969E1 77 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GPR82Q96P67 336 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HINT2Q9BX68 163 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 EPDR1Q9UM22 224 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 NACAE9PAV3 2078 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GW15 77 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR4C46A6NHA9 309 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 E7EUB6 86 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 M0R1B8 84 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 M0R296 226 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SPINK4O60575 86 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FCN3O75636 299 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MOSP00540 346 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 P01737 135 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-7P01780 117 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TCRAP04437 139 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CRYGBP07316 175 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GNG5P63218 68 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 Q56UQ5 140 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LINC01545Q5VT33 79 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 Q6AWC8 147 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SSX8Q7RTT4 187 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DEFB125Q8N687 156 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FDCSPQ8NFU4 85 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF14Q92956 283 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TMEM186Q96B77 213 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CCL13Q99616 98 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OTORQ9NRC9 128 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RNF24Q9Y225 148 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF835Q9Y2P0 537 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CEP290O15078 2479 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 H3BRN7 92 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TAX1BP3O14907 124 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LEPROTL1O95214 131 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 IGLC1P0CG04 106 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 LGALS7P47929 136 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 MAJINQ3KP22 176 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-211ENST00000522045 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.02□□□□□ -1.93
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