RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514654.5

ATP2C1-222, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 1 (best)

Gene ATP2C1, Length 4,730 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRR20A	P86496	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DPM2	O94777	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CD28	P10747	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PDE6H	Q13956	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		K7ERU9	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	UTF1	Q5T230	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TYMS	P04818	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PLA2G5	P39877	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	BLCAP	P62952	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	COTL1	Q14019	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	LAGE3	Q14657	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	VGLL1	Q99990	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		H3BRN7	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		Q6ZPA2	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		F6UB75	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		H3BUT2	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGKC	P01834	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		V9GYV3	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		E7EUB6	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	SPRY2	O43597	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRR25	Q96S07	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		H3BRM9	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLA	Q13239	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CFHR3	Q02985	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC01619	G3V211	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		K7EN84	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	NDUFA4	O00483	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PROP1	O75360	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	INS	P01308	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654		Q8N7P7	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-222	ENST00000514654	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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