RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500800.2

SMARCA5-AS1-201, SMARCA5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCA5-AS1, Length 945 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 A0A1W2PPV4 95 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 KLLNB2CW77 178 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 G3V3Q6 166 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HTN1P15515 57 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ATP6V0CP27449 155 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RANP62826 216 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 OR10G4Q8NGN3 311 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 OR10G9Q8NGN4 311 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 OR10G7Q8NGN6 311 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 VGLL1Q99990 258 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 J3KRW8 73 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NMBP08949 121 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CRISP2P16562 243 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TMEM78Q5T7P6 136 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 C7orf71A4D174 169 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RBAKDNA6NC62 111 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CSN1S1P47710 185 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SERF2P84101 59 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PYGO2Q9BRQ0 406 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZNF492Q9P255 531 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CCDC28AQ8IWP9 274 aa15.93■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa15.92■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.92■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MBP02144 154 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DEFB130BP0DP73 79 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DEFB130AP0DP74 79 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HTN3P15516 51 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZNF138P52744 262 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CD300CQ08708 224 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 BTN1A1Q13410 526 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 OTORQ9NRC9 128 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DIRC3C9JPN6 131 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GPX1P07203 203 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 STAG3L2P0CL84 134 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 STAG3L3P0CL85 134 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CBY3A6NI87 242 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RAB24Q969Q5 203 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DNAH6Q9C0G6 4158 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PGPA6NDG6 321 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FAM74A1Q5RGS3 127 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PRR9Q5T870 116 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 Q8TAT8 98 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SUN5Q8TC36 379 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 LENEPQ9Y5L5 61 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ATP5G1P05496 136 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 P0DMU3 169 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FAM231AP0DMU4 169 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FAM231CP0DMU5 169 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ATP5G3P48201 142 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TMED6Q8WW62 240 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SNURFLB1AK76 121 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TAAR5O14804 337 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ARPC5O15511 151 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HYLS1Q96M11 299 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.85■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.85■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SMLR1H3BR10 107 aa15.84■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GCHFRP30047 84 aa15.84■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CYTL1Q9NRR1 136 aa15.84■□□□□ 0.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 F5H768 121 aa15.83■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CXorf1O96002 111 aa15.83■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 Q6ZQT7 251 aa15.83■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.83■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.83■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ST6GAL2Q96JF0 529 aa15.83■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RGS13O14921 159 aa15.82■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa15.82■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SSX7Q7RTT5 188 aa15.82■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TMEM167BQ9NRX6 74 aa15.82■□□□□ 0.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RPH3ALQ9UNE2 315 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms