RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C16orf95Q9H693 158 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ROS1P08922 2347 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1B0GUT8 65 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 J3KT08 172 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLV2-14P01704 120 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 AZU1P20160 251 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PAX8Q06710 450 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TDRG1Q3Y452 100 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRNTQ86SH4 94 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NUP35Q8NFH5 326 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF183Q96D59 192 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C7orf71A4D174 169 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 F2Z2F3 143 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 OVOL1O14753 267 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NMUP48645 174 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FHL3Q13643 280 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR86Q86TI4 376 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 RCHY1Q96PM5 261 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 EPDR1Q9UM22 224 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NUPR2A6NF83 97 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PYYP10082 97 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FCER1GP30273 86 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LMO4P61968 165 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GUSBP1Q15486 140 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 OR4A5Q8NH83 315 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GGTLC3B5MD39 225 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LY6HO94772 140 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRSS1P07477 247 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 P0C879 139 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLL1P15814 213 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00205P59089 165 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR20EP86478 221 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR20CP86479 221 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR20DP86480 221 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR20BP86481 221 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR20AP86496 221 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CCL25O15444 150 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MOSP00540 346 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TFF1P04155 84 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SAA4P35542 130 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 REG1BP48304 166 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 AJUBAQ96IF1 538 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE12BA1L429 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MUC21Q5SSG8 566 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CD177Q8N6Q3 437 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB37Q96AX2 223 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 EML6Q6ZMW3 1958 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 hDV102S1A0JD36 115 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM231BA6NCW3 169 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE12JA6NER3 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SNCGO76070 127 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE7O76087 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFC2O95298 119 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE12FP0CL80 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE12GP0CL81 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE12IP0CL82 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PSG1P11464 419 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CKS2P33552 79 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CD164Q04900 197 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TNP2Q05952 138 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms