RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 MEGF6O75095 1541 aa5.17□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 NPYP01303 97 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 IGLV2-23P01705 113 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 SMIM11AP58511 58 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 Q8N8P6 123 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5.16□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.15□□□□□ -1.58
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SMIM13P0DJ93 91 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A16P16260 332 aa5.15□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 AQP3Q92482 292 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 BPY2O14599 106 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV1-69P01742 117 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 MIAQ16674 131 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 LUZP6Q538Z0 58 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.14□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF575Q86XF7 245 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 PFN4Q8NHR9 129 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.14□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 MYO10Q9HD67 2058 aa5.14□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 NUP98P52948 1817 aa5.13□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 DOCK1Q14185 1865 aa5.13□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.13□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 C17orf51A8MQB3 221 aa5.13□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.13□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 CCKP06307 115 aa5.13□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.13□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.13□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF524Q96C55 264 aa5.13□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 A6NN06 94 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 K7EM74 188 aa5.12□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 CCL3P10147 92 aa5.12□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 Q1T7F1 81 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 LINC01600Q96MT4 127 aa5.12□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.12□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 C1orf167Q5SNV9 1468 aa5.12□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 MCM3APO60318 1980 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0D9SFI3 127 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SOCS3O14543 225 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 BCE1O60756 84 aa5.11□□□□□ -1.59
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PDCD4-211ENST00000498367 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 KISS1Q15726 138 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 Q8NBF4 154 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 Q96M85 177 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 OR8B2Q96RD0 313 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 CST11Q9H112 138 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 CXCL16Q9H2A7 254 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa5.11□□□□□ -1.59
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