RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 C9JQL5 133 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 C11orf52Q96A22 123 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF479Q96JC4 524 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DENND4CQ5VZ89 1909 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 C8orf49Q96NF6 230 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 DAD1P61803 113 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V0BQ99437 205 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRR20EP86478 221 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRR20CP86479 221 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRR20DP86480 221 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRR20BP86481 221 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRR20AP86496 221 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 GUSBP1Q15486 140 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 HAPLN4Q86UW8 402 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 JPT2Q9H910 190 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 A0A0U1RRA0 63 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 SMKR1H3BMG3 65 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ABCA1O95477 2261 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 26.8
NISCH-213ENST00000489895 CADP27708 2225 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PSCAO43653 123 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TDGF1P3P51864 188 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 NPBQ8NG41 125 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TMEM141Q96I45 108 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TTC28Q96AY4 2481 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PAX4O43316 350 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-39P01824 125 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 FXYD5Q96DB9 178 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 SPXQ9BT56 116 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TMEM213A2RRL7 107 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 AZU1P20160 251 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 I3L3M4 83 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-59P01825 116 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ATXN8Q156A1 80 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 Q8N8P6 123 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 CYYR1Q96J86 154 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 VWC2Q2TAL6 325 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 CST9LQ9H4G1 147 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 A8MWP6 167 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRO3102Q9H379 93 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 KLK9Q9UKQ9 250 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PRR31Q5SQ13 230 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 C10orf91Q5T1B1 145 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 V9GYV3 84 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TECTAO75443 2155 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 ZNF114Q8NC26 417 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 F5H768 121 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 FOXE3Q13461 319 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 PYY3Q5JQD4 70 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 SEM1Q6ZVN7 128 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 hDV102S1A0JD36 115 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 CREBBPQ92793 2442 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 KNCNA6PVL3 124 aa13.46□□□□□ -0.25
NISCH-213ENST00000489895 LYPD6Q86Y78 171 aa13.46□□□□□ -0.26
NISCH-213ENST00000489895 GAGE12JA6NER3 117 aa13.45□□□□□ -0.26
NISCH-213ENST00000489895 GAGE1Q13065 139 aa13.45□□□□□ -0.26
NISCH-213ENST00000489895 GAGE4Q13068 117 aa13.45□□□□□ -0.26
NISCH-213ENST00000489895 GAGE5Q13069 117 aa13.45□□□□□ -0.26
NISCH-213ENST00000489895 GAGE13Q4V321 117 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98 ms