RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 A8MZ25 164 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 AMBPP02760 352 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 HLA-DMBP28068 263 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 AKR1C3P42330 323 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 STHQ8IWL8 128 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 Q8N1Y9 231 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SMIM12Q96EX1 92 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 RARRES2Q99969 163 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 H3BMM0 161 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TSPOP30536 169 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ZNF138P52744 262 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 UBE2G1P62253 170 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-11P60412 298 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 GNG5P63218 68 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 COMMD7Q86VX2 200 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TREM1Q9NP99 234 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ZNF492Q9P255 531 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 C9JCJ5 164 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 PRAC2D3DTV9 90 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 LEPP41159 167 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 TUBA4BQ9H853 241 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 BIN3Q9NQY0 253 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 PSG8Q9UQ74 426 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 KNCNA6PVL3 124 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 IGLV2-11P01706 119 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 CRISP2P16562 243 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 DEFB125Q8N687 156 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 PRR25Q96S07 402 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 VGLL1Q99990 258 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 PARLQ9H300 379 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 F6UB75 175 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 UBE2CO00762 179 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 LTAP01374 205 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 GNG4P50150 75 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 APOC4P55056 127 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 AMTNQ6UX39 209 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 B9D2Q9BPU9 175 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 ZNF727A8MUV8 499 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 CT45A10P0DMU9 189 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 CDKN1BP46527 198 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 ERCC8Q13216 396 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 PRNTQ86SH4 94 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 Q86TA4 180 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 BAGE2Q86Y30 109 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 CITED4Q96RK1 184 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 TMEM218A2RU14 115 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 KLLNB2CW77 178 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 SFTA3P0C7M3 94 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 SMUG1Q53HV7 270 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 LINC00479Q96M42 142 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 MLST8Q9BVC4 326 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-211ENST00000488243 CSTL1Q9H114 145 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms