RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486166.1

RBBP7-211, Transcript of RB binding protein 7, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBBP7, Length 1,535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7-211ENST00000486166 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.28□□□□□ -1.24
RBBP7-211ENST00000486166 MPDU1O75352 247 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 GALR1P47211 349 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 B2MP61769 119 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 LCE4AQ5TA78 99 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 S100A7AQ86SG5 101 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 ATP5SQ99766 215 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RSG1Q9BU20 258 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 PSMG4Q5JS54 123 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 ZNF709Q8N972 641 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 C11orf52Q96A22 123 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RCHY1Q96PM5 261 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 WFDC1Q9HC57 220 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 K7EQD1 137 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 IFNA5P01569 189 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 GPR82Q96P67 336 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 KNCNA6PVL3 124 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SMLR1H3BR10 107 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 NXPH4O95158 308 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 LINC00052Q96N35 136 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 AQP10Q96PS8 301 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 PFDN5Q99471 154 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RETNQ9HD89 108 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 G3V3Q6 166 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SOCS3O14543 225 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 MEOX2P50222 304 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 APOC4P55056 127 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 Q6ZRP5 223 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RNF24Q9Y225 148 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 U3KQK5 164 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 ISLRO14498 428 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 PSMB3P49720 205 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 DEFB1P60022 68 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 FAM78BQ5VT40 261 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SMIM29Q86T20 159 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RFNGQ9Y644 331 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 ARPC5O15511 151 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 ZNF266Q14584 549 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 RNF182Q8N6D2 247 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 DEFB135Q30KP9 77 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP7-211ENST00000486166 COL7A1Q02388 2944 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 F6UB75 175 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 H3BQ15 152 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 IGKV3-20P01619 116 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 HLA-DMBP28068 263 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 MFFQ9GZY8 342 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 RPRMQ9NS64 109 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.2□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 H3BMM0 161 aa7.2□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 SLC17A3O00476 420 aa7.2□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 IGLC2P0DOY2 106 aa7.2□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 PYYP10082 97 aa7.2□□□□□ -1.26
RBBP7-211ENST00000486166 HLA-DRB4P13762 266 aa7.2□□□□□ -1.26
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