RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GPHB5Q86YW7 130 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 STOML3Q8TAV4 291 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RABAC1Q9UI14 185 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 COL6A5A8TX70 2615 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PPV4 95 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf70A6NJV1 201 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF98A6NK75 572 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OVOL1O14753 267 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SAP30O75446 220 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SCGB2A1O75556 95 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR10J4P0C629 311 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SEC11BP0C7V7 166 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PYYP10082 97 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FOLR2P14207 255 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IGLL1P15814 213 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CBLN1P23435 193 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TFPI2P48307 235 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RIPPLY3P57055 190 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SELENOTP62341 195 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 HERV-K104P63124 156 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF726P1Q15940 193 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TEX261Q6UWH6 196 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 LCN15Q6UWW0 184 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR4F4Q96R69 305 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 METTL26Q96S19 204 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RNF2Q99496 336 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MLXQ9UH92 298 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SMPXQ9UHP9 88 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 VWFP04275 2813 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 H3BQ15 152 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 H3BRN7 92 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 K7EMT4 169 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS9O00182 355 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CHEK1O14757 476 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 M6PRP20645 277 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CRYBB3P26998 211 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SULT1A2P50226 295 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PLP1P60201 277 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RHOBP62745 196 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CCL20P78556 96 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SERF2P84101 59 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TCF24Q7RTU0 167 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 BLNKQ8WV28 456 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PFDN5Q99471 154 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FUT9Q9Y231 359 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0U1RRA0 63 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 A8MWP6 167 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR7C2O60412 319 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IFNA7P01567 189 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MBP02144 154 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf88P0DMB2 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DMBP28068 263 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB1P60022 68 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2G2P60604 165 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GUCA2BQ16661 112 aa3.49□□□□□ -1.85
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