RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 TAS2R60P59551 318 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 TAAR5O14804 337 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.87□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 C16orf74Q96GX8 76 aa14.86□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 IGLL5B9A064 214 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 STAG3L2P0CL84 134 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 STAG3L3P0CL85 134 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 AZU1P20160 251 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 RAB24Q969Q5 203 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 VGLL1Q99990 258 aa14.85□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 LY6G6CO95867 125 aa14.84□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 TCTAP57738 103 aa14.84□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 ZNF345Q14585 488 aa14.84□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.84□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 HYLS1Q96M11 299 aa14.84□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 OTORQ9NRC9 128 aa14.84□□□□□ -0.03
NELFE-208ENST00000481121 C7orf71A4D174 169 aa14.83□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 RBAKDNA6NC62 111 aa14.83□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.83□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.83□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.83□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 LYRM9A8MSI8 78 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 KLLNB2CW77 178 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 CRISP2P16562 243 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 DAD1P61803 113 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 BTN1A1Q13410 526 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 Q8TAT8 98 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 ZNF492Q9P255 531 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 PGPA6NDG6 321 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 HMSDA8MTL9 139 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 DIRC3C9JPN6 131 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 GPX1P07203 203 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 ZNF138P52744 262 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.82□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.81□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 CXorf1O96002 111 aa14.81□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 NMBP08949 121 aa14.81□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 GCHFRP30047 84 aa14.81□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.81□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.81□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 CD300CQ08708 224 aa14.8□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 SSX7Q7RTT5 188 aa14.8□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 HTN3P15516 51 aa14.79□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.79□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.79□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.79□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 APLNQ9ULZ1 77 aa14.79□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.78□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.78□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 PRR9Q5T870 116 aa14.78□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 A0A0D9SG52 128 aa14.77□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 DEFB130BP0DP73 79 aa14.77□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 DEFB130AP0DP74 79 aa14.77□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 ZNF726P1Q15940 193 aa14.77□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.77□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.77□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 SUN5Q8TC36 379 aa14.77□□□□□ -0.04
NELFE-208ENST00000481121 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 SNURFLB1AK76 121 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 BCL2L11O43521 198 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 GNG5P63218 68 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 TMED6Q8WW62 240 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.76□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.75□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.75□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 CBY3A6NI87 242 aa14.74□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 Q6ZNX1 250 aa14.74□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.74□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.74□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 GGTLC3B5MD39 225 aa14.73□□□□□ -0.05
NELFE-208ENST00000481121 RGS13O14921 159 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms