RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087WW49	117 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	SH2D1A	O60880	128 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	GZMB	P10144	247 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZSV7	163 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF138	P52744	262 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	CAMP	P49913	170 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	LGALS9	O00182	355 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	SOCS3	O14543	225 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	APCS	P02743	223 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	HBB	P68871	147 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	OVOL1	O14753	267 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	CRISP2	P16562	243 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	EDN2	P20800	178 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GCFC2-208	ENST00000472230		A8MWP6	167 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM160	Q9NX00	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GXF2	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	ID1	P41134	155 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6AWC8	147 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SRD5A1	P18405	259 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	DPF1	Q92782	380 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	IFITM10	A6NMD0	228 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230		M0QZ24	198 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	FABP4	P15090	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01619	G3V211	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	RIG	Q13278	110 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GUT8	65 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	ORM1	P02763	201 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	C12orf57	Q99622	126 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	HAX1	O00165	279 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SLA	Q13239	276 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	BAGE3	Q86Y29	109 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SMR3A	Q99954	134 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM6	P0DI80	62 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SLURP1	P55000	103 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	SRI	P30626	198 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GUS0	222 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	TFPI2	P48307	235 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230		Q0VG73	95 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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