RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	STAG3L3	P0CL85	134 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	CELA1	Q9UNI1	258 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	GCHFR	P30047	84 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	VGLL1	Q99990	258 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	CXorf1	O96002	111 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		12.75	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	BCL2L11	O43521	198 aa		12.74	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMUB2	Q71RG4	321 aa		12.74	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	SSX7	Q7RTT5	188 aa		12.74	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	DIRC3	C9JPN6	131 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902		H7BYZ3	331 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	GPX1	P07203	203 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R60	P59551	318 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZTC4	211 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902		Q8TAT8	98 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		12.73	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	AZU1	P20160	251 aa		12.72	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	ZNF138	P52744	262 aa		12.72	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	ZNF726P1	Q15940	193 aa		12.72	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	AKAP14	Q86UN6	197 aa		12.72	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	C7orf71	A4D174	169 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	RBAKDN	A6NC62	111 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	BTN1A1	Q13410	526 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	ZNF492	Q9P255	531 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.71	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	GNG5	P63218	68 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	CD300C	Q08708	224 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	C16orf74	Q96GX8	76 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.7	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	SEC11B	P0C7V7	166 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	CRISP2	P16562	243 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		12.69	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	KLLN	B2CW77	178 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	IGLL5	B9A064	214 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	C1QB	P02746	253 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	NMB	P08949	121 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	HTN3	P15516	51 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	FHIT	P49789	147 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	UBE2G2	P60604	165 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	DAD1	P61803	113 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	STOML3	Q8TAV4	291 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		12.68	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	UMAD1	C9J7I0	102 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		12.67	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902		K7EQM0	130 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	IFNA7	P01567	189 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	DEFB130B	P0DP73	79 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	DEFB130A	P0DP74	79 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	PRR9	Q5T870	116 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		12.66	□□□□□ -0.38
USP19-210	ENST00000465902	SGK494	Q96LW2	274 aa		12.66	□□□□□ -0.38

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