RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 FUT9Q9Y231 359 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLL5B9A064 214 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA5P01569 189 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 HBE1P02100 147 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 PET100P0DJ07 73 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V0CP27449 155 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKN1BP46527 198 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 CD300CQ08708 224 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 GUK1Q16774 197 aa4.97□□□□□ -1.61
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RABGEF1-206ENST00000461017 PET117Q6UWS5 81 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 SSX7Q7RTT5 188 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-206ENST00000461017 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.97□□□□□ -1.61
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RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 INSP01308 110 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 HTN1P15515 57 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 M6PRP20645 277 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01587Q99440 93 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 Q9H3A6 140 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 MUC4Q99102 2169 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8TAT8 98 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM189A5PLL7 270 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 PGPA6NDG6 321 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 DIRC3C9JPN6 131 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 STAG3L2P0CL84 134 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 STAG3L3P0CL85 134 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 TSPOP30536 169 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 TVP23CQ96ET8 276 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00477Q96M19 166 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF492Q9P255 531 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPV4 95 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf71A4D174 169 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB130BP0DP73 79 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB130AP0DP74 79 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 CRISP2P16562 243 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 LEPP41159 167 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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