RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440984.3

ZNF140-208, Transcript of zinc finger protein 140, human

TSL 3

Gene ZNF140, Length 529 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF140-208	ENST00000440984	VGLL1	Q99990	258 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	UBE2C	O00762	179 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	BCL2	P10415	239 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	VAX2	Q9UIW0	290 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ZNF140-208	ENST00000440984	PEX7	O00628	323 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	ZNF138	P52744	262 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	TSPO	P30536	169 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	FXYD7	P58549	80 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	AMBP	P02760	352 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	RARRES2	Q99969	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	LEP	P41159	167 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	CLLU1	Q5K131	121 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	ASCL2	Q99929	193 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	XCL2	Q9UBD3	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984		M0R2Z0	102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	PDE6D	O43924	150 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	CDKN1B	P46527	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984		Q6ZWC4	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984		Q8TAT8	98 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	SGK494	Q96LW2	274 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	PSG8	Q9UQ74	426 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	AKR1C3	P42330	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	C11orf52	Q96A22	123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF140-208	ENST00000440984	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	CRISP2	P16562	243 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	RGS13	O14921	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	UBE2G1	P62253	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TREM1	Q9NP99	234 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	KLLN	B2CW77	178 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984		J3KRW8	73 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	SPRY2	O43597	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	GPX1	P07203	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	RNF183	Q96D59	192 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TVP23C	Q96ET8	276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	INS	P01308	110 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	TMEM250	H0YL14	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984		Q86TA4	180 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	C7orf71	A4D174	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ZNF140-208	ENST00000440984	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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