RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 M0R3E3 92 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 PDE6DO43924 150 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 PSMG4Q5JS54 123 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 PEX7O00628 323 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SPRY2O43597 315 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 APOC4P55056 127 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 GNG5P63218 68 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA5Q16718 116 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 UQCC3Q6UW78 93 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 EPDR1Q9UM22 224 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 DIRC3C9JPN6 131 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 TCRAP04437 139 aa9.13□□□□□ -0.95
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PRAME-208ENST00000438888 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 C11orf52Q96A22 123 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 ATG101Q9BSB4 218 aa9.13□□□□□ -0.95
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PRAME-208ENST00000438888 TREM1Q9NP99 234 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.12□□□□□ -0.95
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PRAME-208ENST00000438888 K7EQM0 130 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 AKR1C3P42330 323 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 DEFB131AP59861 70 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZWC4 215 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 C9JQL5 133 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 PRAC2D3DTV9 90 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 AGRNO00468 2067 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 RBAKDNA6NC62 111 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 F6UB75 175 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 CEBPGP53567 150 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 DEFB1P60022 68 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 ZNF124Q15973 351 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.1□□□□□ -0.95
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PRAME-208ENST00000438888 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.1□□□□□ -0.95
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PRAME-208ENST00000438888 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 RNF183Q96D59 192 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 A0A0J9YX75 114 aa9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-208ENST00000438888 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 SFTA3P0C7M3 94 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 UBE2G1P62253 170 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 FMC1Q96HJ9 113 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 LINC00479Q96M42 142 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-208ENST00000438888 VGLL1Q99990 258 aa9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-208ENST00000438888 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 KNCNA6PVL3 124 aa9.08□□□□□ -0.96
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
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PRAME-208ENST00000438888 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
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PRAME-208ENST00000438888 DERL1Q9BUN8 251 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 PARLQ9H300 379 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.08□□□□□ -0.96
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