RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428732.1

DEPDC1-AS1-201, DEPDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DEPDC1-AS1, Length 1,247 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.96□□□□□ -0.97
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CD300CQ08708 224 aa8.96□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ERCC8Q13216 396 aa8.96□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BTN1A1Q13410 526 aa8.96□□□□□ -0.98
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MIC13Q5XKP0 118 aa8.96□□□□□ -0.98
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.92□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PRO0255Q9UI72 69 aa8.92□□□□□ -0.98
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.91□□□□□ -0.98
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BLNKQ8WV28 456 aa8.91□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 C8orf49Q96NF6 230 aa8.91□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.91□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.91□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PRAF2O60831 178 aa8.9□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PDE6HQ13956 83 aa8.9□□□□□ -0.98
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FHL2Q14192 279 aa8.9□□□□□ -0.98
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