RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 TREM1Q9NP99 234 aa10.64□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.64□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.64□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 A8MTW9 85 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 H3BMM0 161 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 HLA-DRB4P13762 266 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 AKR1C3P42330 323 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 CNN1P51911 297 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF124Q15973 351 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 FMC1Q96HJ9 113 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.63□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 KNCNA6PVL3 124 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TAS2R60P59551 318 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ERCC8Q13216 396 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 DERL1Q9BUN8 251 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF492Q9P255 531 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 PSG8Q9UQ74 426 aa10.62□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ACTL10Q5JWF8 245 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ODF3Q96PU9 254 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 CITED4Q96RK1 184 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 PRR25Q96S07 402 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 PARLQ9H300 379 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.61□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM218A2RU14 115 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 CT45A10P0DMU9 189 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF138P52744 262 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 UBE2G1P62253 170 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 SOHLH1Q5JUK2 328 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 AMTNQ6UX39 209 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 DEFB125Q8N687 156 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 SGK494Q96LW2 274 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.6□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 C9JCJ5 164 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 LTAP01374 205 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 SFTA3P0C7M3 94 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 Q86TA4 180 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 STHQ8IWL8 128 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 TVP23CQ96ET8 276 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.59□□□□□ -0.71
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF727A8MUV8 499 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 CRISP2P16562 243 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 CEBPGP53567 150 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 PRNTQ86SH4 94 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 BAGE2Q86Y30 109 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 MLST8Q9BVC4 326 aa10.58□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 A8MZ25 164 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 IGLV2-8P01709 118 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 CENPWQ5EE01 88 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 Q8TAT8 98 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 SMIM12Q96EX1 92 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.57□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 IGKV3-20P01619 116 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 GNG4P50150 75 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 SEC11CQ9BY50 192 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.56□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 KLLNB2CW77 178 aa10.55□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 ADCYAP1P18509 176 aa10.55□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 TSPOP30536 169 aa10.55□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 LEPP41159 167 aa10.55□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 OCC1Q8TAD7 63 aa10.55□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 ASCL2Q99929 193 aa10.55□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 F8W036 122 aa10.54□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.54□□□□□ -0.72
SFTA3-201ENST00000418548 CDKN1BP46527 198 aa10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms