RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RFNGQ9Y644 331 aa5.51□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM189A5PLL7 270 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 CXorf1O96002 111 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 INSP01308 110 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 SEC11BP0C7V7 166 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 TSPOP30536 169 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 RAB5CP51148 216 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 EMP1P54849 157 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 RAB2AP61019 212 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 CD300CQ08708 224 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP69Q49AA0 526 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 AMTNQ6UX39 209 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 TMUB2Q71RG4 321 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.5□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 H3BQ15 152 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 TEX46H3BTG2 121 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 M0R2Z0 102 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 HBE1P02100 147 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 STAG3L2P0CL84 134 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 STAG3L3P0CL85 134 aa5.49□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf74Q32Q52 190 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 MORN5Q5VZ52 161 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 SLC51BQ86UW2 128 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 BAP18Q8IXM2 172 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 BLNKQ8WV28 456 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 RAB24Q969Q5 203 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 FXYD5Q96DB9 178 aa5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.49□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.49□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC17A3O00476 420 aa5.48□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC00477Q96M19 166 aa5.48□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 RANP62826 216 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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SGMS1-201ENST00000361543 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.47□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.47□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.47□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRE2 83 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB4O95168 129 aa5.46□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 GCHFRP30047 84 aa5.46□□□□□ -1.54
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