RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 SNAI2O43623 268 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 FGF6P10767 208 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 CRYBA4P53673 196 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 LINC01545Q5VT33 79 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 GAGE12HA6NDE8 117 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 CAMPP49913 170 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 CKS1BP61024 79 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PRCDQ00LT1 54 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PIFOQ8TCI5 191 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 ZNF503Q96F45 646 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PRR20EP86478 221 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PRR20CP86479 221 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PRR20DP86480 221 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PRR20BP86481 221 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PRR20AP86496 221 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 RABAC1Q9UI14 185 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TNCP24821 2201 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 HIGD1CA8MV81 97 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TEPPQ6URK8 271 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 HINT2Q9BX68 163 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 A6NDX4 124 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 H3BUX3 64 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 CNIH1O95406 144 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 SPATA25Q9BR10 227 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 PRR31Q5SQ13 230 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 Q6YL49 198 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 Q8N9W7 124 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 DPF1Q92782 380 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.98□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 MYOD1P15172 320 aa7.97□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 RAB37Q96AX2 223 aa7.97□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 LINC00479Q96M42 142 aa7.97□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.97□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 H0Y8G0 127 aa7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 LY6G6DO95868 133 aa7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 FABP2P12104 132 aa7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 HBBP68871 147 aa7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 FA2HQ7L5A8 372 aa7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
GINS3-201ENST00000318129 LY6EQ16553 131 aa7.96□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.96□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 TMEM86BQ8N661 226 aa7.96□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.96□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 TMEM219Q86XT9 240 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 ARPC1AQ92747 370 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 ATRQ13535 2644 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 CGB1A6NKQ9 187 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 E7EUB6 86 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 IGHV4-59P01825 116 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 C2orf83Q53S99 150 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 MRAP2Q96G30 205 aa7.95□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 PLXNB1O43157 2135 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 SIVA1O15304 175 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 ZNF138P52744 262 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 BLNKQ8WV28 456 aa7.94□□□□□ -1.14
GINS3-201ENST00000318129 ZNF747Q9BV97 191 aa7.94□□□□□ -1.14
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