RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.04□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.04□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 ARL6Q9H0F7 186 aa7.04□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.04□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 RNF222A6NCQ9 220 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 BCL2L11O43521 198 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 CXCL2P19875 107 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 EVI2AP22794 236 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 PSG3Q16557 428 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 TEX261Q6UWH6 196 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 PRR13Q9NZ81 148 aa7.03□□□□□ -1.28
USP41-201ENST00000292729 K7EPK0 472 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 PAX4O43316 350 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 PITX3O75364 302 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 MED6O75586 246 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ORM2P19652 201 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 S100A10P60903 97 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RAB11AP62491 216 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 Q6ZTI0 123 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 OR1S1Q8NH92 325 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 STOML3Q8TAV4 291 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RBKSQ9H477 322 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.02□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 A0A087X0K7 114 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 H0YIZ8 118 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 H3BRN7 92 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 WRBO00258 174 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 PSCAO43653 123 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ID3Q02535 119 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 BAXQ07812 192 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 SLAQ13239 276 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.01□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 TSC22D2O75157 780 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 SCGB1D2O95969 90 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 TAS2R30P59541 319 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 S100A7AQ86SG5 101 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 Q8N814 137 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ZNF680Q8NEM1 530 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 PRO0255Q9UI72 69 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RNF24Q9Y225 148 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 FUT9Q9Y231 359 aa7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RAB14P61106 215 aa6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 VAMP2P63027 116 aa6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ZNF266Q14584 549 aa6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 KIR3DS1Q14943 382 aa6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 CLLU1Q5K131 121 aa6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 Q6ZSA8 131 aa6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 CRYGDP07320 174 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 CRYBA4P53673 196 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 STX12Q86Y82 276 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ODF3Q96PU9 254 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.98□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 SYNGR2O43760 224 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 SPINK4O60575 86 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 HYPMO75409 117 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 LEPP41159 167 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 PLP1P60201 277 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms